300094 PP Proteomics in systembiology

Studienprogrammleitung Biologie

6 Stunde(n), 10,0 ECTS credits

Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Kapitel:30.01

Stefanie Wienkoop , Gert Bachmann , David Lyon , Luis Recuenco-Munoz

Block vom 24.4.-30.4.2013, 9:00 Uhr im Seminarraum 1320.

Inhalte: Die Begriffe „Proteomics“ und „Metabolomics“ haben sich in den letzten Jahren gepraegt und sind inzwischen zu einem festen Bestandteil der modernen Biologie geworden. Analog zum Genom (Gesamtheit aller Erbinformation), Metabolom (Gesamtheit aller Metabolite) stellt das Proteom die Gesamtheit aller aktiven Proteine einer Zelle oder eines Gewebes -also der Proteine/Enzyme aus den verschiedenen Stoffwechselwegen - einer Zelle oder eines Gewebes dar. Die Diversität und Dynamik der Proteine eines Organsimus stellt hohe Anforderungen an bioanalytische Technologien, insbesondere die Massenspektrometrie. Im Rahmen dieses Projektpraktikums sollen Grundbegriffe der Technologie Proteomics vermittelt werden und eine spezielle Technik der massenspektrometrischen Analyse und Datenauswertung („shotgun proteomics“ Identifizierung und Quantifizierung) von Proteinen durchgefuehrt werden. Gleichzeitig werden Grundkenntnisse fuer die Massenspektrometrie in der modernen Biologie vermittelt.

Methoden: Proteinextraktion, Proteinverdau, Peptidauftrennung HPLC, Massenspektrometrie (Protein identifikation und relative Quantifikation), Datenanalyse und Interpretation